NO2さん。有難うございます～＾＾
これで安心して登録制のバイトをする決意ができました！
パソコンをしばらくつけていなかったので返事が遅くなってしまいましたが詳しく教えていただいて本当に有難うございました。

“登録制のバイト”であれば、税金関係で本業にバレる事はありませんよ。
わたしも同じような経験があり、
登録制バイトを何回かしたことがあります。
最初の登録説明会の時に、担当の方に聞いたことがあります。
“登録制”であれば、１日単位での雇入扱いになるそうです。
（採用・退職を１日単位で行ってるという事です）

登録制ではない、普通のバイトの場合、
所得税が発生してしまうので、
年末調整で、２社から収入金額が税務署・役所に提出されてしまうので、
本業の会社のほうに、他に収入源があったことがバレる可能性があります。